hello readers, dosenku pernah mengatakan bahwa era sekarang adalah era biologi molekular, nah kali ini aku datang dengan membawa hasil analisis kodon dari bacteri phiX174, semoga bermanfaat :)
Enterobacteria phage phiX174 sensu lato, complete genome
ORIGIN
61
aaattatctt gataaagcag gaattactac tgcttgttta cgaattaaat cgaagtggac
121
tgctggcgga aaatgagaaa attcgaccta tccttgcgca gctcgagaag
ctcttacttt
181
gcgacctttc gccatcaact aacgattctg tcaaaaactg acgcgttgga tgaggagaag
241
tggcttaata tgcttggcac gttcgtcaag gactggttta gatatgagtc
acattttgtt
301
catggtagag attctcttgt tgacatttta aaagagcgtg gattactatc tgagtccgat
361
gctgttcaac cactaatagg taagaaatca tgagtcaagt tactgaacaa tccgtacgtt
421
tccagaccgc tttggcctct attaagctca ttcaggcttc tgccgttttg gatttaaccg
481 aagatgattt cgattttctg acgagtaaca aagtttggat tgctactgac cgctctcgtg
541
ctcgtcgctg cgttgaggct tgcgtttatg gtacgctgga ctttgtggga
taccctcgct
601
ttcctgctcc tgttgagttt attgctgccg tcattgctta ttatgttcat cccgtcaaca
661
ttcaaacggc ctgtctcatc atggaaggcg ctgaatttac ggaaaacatt attaatggcg
721
tcgagcgtcc ggttaaagcc gctgaattgt tcgcgtttac cttgcgtgta cgcgcaggaa
781
acactgacgt tcttactgac gcagaagaaa acgtgcgtca aaaattacgt gcggaaggag
841 tgatgtaatg tctaaaggta aaaaacgttc tggcgctcgc cctggtcgtc cgcagccgtt
901
gcgaggtact aaaggcaagc gtaaaggcgc tcgtctttgg tatgtaggtg gtcaacaatt
961
ttaattgcag gggcttcggc cccttacttg aggataaatt atgtctaata ttcaaactgg
1021
cgccgagcgt atgccgcatg acctttccca tcttggcttc cttgctggtc agattggtcg
1081
tcttattacc atttcaacta ctccggttat cgctggcgac tccttcgaga tggacgccgt
1141
tggcgctctc cgtctttctc cattgcgtcg tggccttgct attgactcta ctgtagacat
1201
ttttactttt tatgtccctc atcgtcacgt ttatggtgaa cagtggatta agttcatgaa
1261
ggatggtgtt aatgccactc ctctcccgac tgttaacact actggttata ttgaccatgc
1321
cgcttttctt ggcacgatta accctgatac caataaaatc cctaagcatt tgtttcaggg
1381
ttatttgaat atctataaca actattttaa agcgccgtgg atgcctgacc gtaccgaggc
1441 taaccctaat gagcttaatc aagatgatgc tcgttatggt ttccgttgct gccatctcaa
1501
aaacatttgg actgctccgc ttcctcctga gactgagctt tctcgccaaa
tgacgacttc
1561
taccacatct attgacatta tgggtctgca agctgcttat gctaatttgc atactgacca
1621 agaacgtgat tacttcatgc agcgttacca tgatgttatt tcttcatttg gaggtaaaac
1681 ctcttatgac gctgacaacc gtcctttact
tgtcatgcgc tctaatctct gggcatctgg
1741 ctatgatgtt gatggaactg accaaacgtc gttaggccag ttttctggtc gtgttcaaca
1801 gacctataaa cattctgtgc cgcgtttctt tgttcctgag catggcacta tgtttactct
1861
tgcgcttgtt cgttttccgc ctactgcgac taaagagatt cagtacctta acgctaaagg
1921
tgctttgact tataccgata ttgctggcga ccctgttttg tatggcaact tgccgccgcg
1981 tgaaatttct atgaaggatg ttttccgttc tggtgattcg tctaagaagt ttaagattgc
2041 tgagggtcag tggtatcgtt atgcgccttc gtatgtttct cctgcttatc accttcttga
2101
aggcttccca ttcattcagg aaccgccttc tggtgatttg caagaacgcg tacttattcg
2161 ccaccatgat tatgaccagt gtttccagtc cgttcagttg ttgcagtgga atagtcaggt
2221 taaatttaat gtgaccgttt atcgcaatct gccgaccact cgcgattcaa
tcatgacttc
2281
gtgataaaag attgagtgtg aggttataac gccgaagcgg taaaaatttt aatttttgcc
2341
gctgaggggt tgaccaagcg aagcgcggta ggttttctgc ttaggagttt aatcatgttt
2401
cagactttta tttctcgcca taattcaaac tttttttctg ataagctggt tctcacttct
2461
gttactccag cttcttcggc acctgtttta cagacaccta aagctacatc gtcaacgtta
2521
tattttgata gtttgacggt taatgctggt aatggtggtt ttcttcattg cattcagatg
2581
gatacatctg tcaacgccgc taatcaggtt gtttctgttg gtgctgatat tgcttttgat
2641
gccgacccta aattttttgc ctgtttggtt cgctttgagt cttcttcggt tccgactacc
2701
ctcccgactg cctatgatgt ttatcctttg aatggtcgcc atgatggtgg ttattatacc
2761
gtcaaggact gtgtgactat tgacgtcctt ccccgtacgc cgggcaataa cgtttatgtt
2821 ggtttcatgg tttggtctaa ctttaccgct actaaatgcc gcggattggt ttcgctgaat
2881
caggttatta aagagattat ttgtctccag ccacttaagt gaggtgattt atgtttggtg
2941
ctattgctgg cggtattgct tctgctcttg ctggtggcgc catgtctaaa ttgtttggag
3001
gcggtcaaaa agccgcctcc ggtggcattc aaggtgatgt gcttgctacc gataacaata
3061 ctgtaggcat gggtgatgct ggtattaaat ctgccattca aggctctaat
gttcctaacc
3121 ctgatgaggc cgcccctagt tttgtttctg gtgctatggc taaagctggt aaaggacttc
3181
ttgaaggtac gttgcaggct ggcacttctg ccgtttctga taagttgctt gatttggttg
3241
gacttggtgg caagtctgcc gctgataaag gaaaggatac tcgtgattat cttgctgctg
3301
catttcctga gcttaatgct tgggagcgtg ctggtgctga tgcttcctct gctggtatgg
3361
ttgacgccgg atttgagaat caaaaagagc ttactaaaat gcaactggac aatcagaaag
3421
agattgccga gatgcaaaat gagactcaaa aagagattgc tggcattcag tcggcgactt
3481
cacgccagaa tacgaaagac caggtatatg cacaaaatga gatgcttgct tatcaacaga
3541
aggagtctac tgctcgcgtt gcgtctatta tggaaaacac caatctttcc aagcaacagc
3601
aggtttccga gattatgcgc caaatgctta ctcaagctca aacggctggt cagtatttta
3661 ccaatgacca aatcaaagaa atgactcgca aggttagtgc tgaggttgac ttagttcatc
3721
agcaaacgca gaatcagcgg tatggctctt ctcatattgg
cgctactgca aaggatattt
3781 ctaatgtcgt cactgatgct gcttctggtg tggttgatat ttttcatggt attgataaag
3841
ctgttgccga tacttggaac aatttctgga aagacggtaa agctgatggt attggctcta
3901
atttgtctag gaaataaccg tcaggattga caccctccca attgtatgtt ttcatgcctc
3961
caaatcttgg aggctttttt atggttcgtt cttattaccc ttctgaatgt cacgctgatt
4021
attttgactt tgagcgtatc gaggctctta aacctgctat tgaggcttgt ggcatttcta
4081
ctctttctca atccccaatg cttggcttcc ataagcagat ggataaccgc atcaagctct
4141
tggaagagat tctgtctttt cgtatgcagg gcgttgagtt cgataatggt gatatgtatg
4201
ttgacggcca taaggctgct tctgacgttc gtgatgagtt tgtatctgtt
actgagaagt
4261 taatggatga attggcacaa tgctacaatg tgctccccca acttgatatt aataacacta
4321 tagaccaccg ccccgaaggg gacgaaaaat ggtttttaga gaacgagaag acggttacgc
4381
agttttgccg caagctggct gctgaacgcc ctcttaagga tattcgcgat gagtataatt
4441
accccaaaaa gaaaggtatt aaggatgagt gttcaagatt
gctggaggcc tccactatga
4501
aatcgcgtag aggctttgct attcagcgtt tgatgaatgc aatgcgacag gctcatgctg
4561 atggttggtt tatcgttttt gacactctca cgttggctga cgaccgatta gaggcgtttt
4621 atgataatcc caatgctttg cgtgactatt ttcgtgatat tggtcgtatg
gttcttgctg
4681
ccgagggtcg caaggctaat gattcacacg ccgactgcta tcagtatttt tgtgtgcctg
4741 agtatggtac agctaatggc cgtcttcatt tccatgcggt gcactttatg cggacacttc
4801
ctacaggtag cgttgaccct aattttggtc gtcgggtacg caatcgccgc cagttaaata
4861
gcttgcaaaa tacgtggcct tatggttaca gtatgcccat
cgcagttcgc tacacgcagg
4921
acgctttttc acgttctggt tggttgtggc ctgttgatgc taaaggtgag ccgcttaaag
4981
ctaccagtta tatggctgtt ggtttctatg tggctaaata cgttaacaaa
aagtcagata
5041
tggaccttgc tgctaaaggt ctaggagcta aagaatggaa caactcacta aaaaccaagc
5101
tgtcgctact tcccaagaag ctgttcagaa tcagaatgag ccgcaacttc gggatgaaaa
5161
tgctcacaat gacaaatctg tccacggagt gcttaatcca acttaccaag
ctgggttacg
5221
acgcgacgcc gttcaaccag atattgaagc agaacgcaaa aagagagatg agattgaggc
5281
tgggaaaagt tactgtagcc gacgttttgg cggcgcaacc tgtgacgaca aatctgctca
5341
aatttatgcg cgcttcgata aaaatgattg gcgtatccaa cctgca
Keterangan :
Warna hijau background kuning : Kodon Start (atg)
Warna
merah background
biru :
Kodon Stop (taa, tag, tga)
0 comments:
Post a Comment